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（1）机械混杂。在生产过程中，在种子处理、插秧、收获、加工、储藏、运输等各个环节上，都会造成机械混杂。 （2）环境条件。品种各个优良性状的发育都要求一定的环境条件，若这些条件不能满足时，就会发生变异，促使品种退化。 （3）自然杂交。自然杂交是异花授粉作物混杂退化的主要原因。水稻自然杂交率一般在1%以下，但也会发生自然杂交而造成混杂退化的情况。 （4）自然突变。自然界物种的稳定是相对的，变异是绝对的，水稻品种也是如此。如遇冷水、盐碱、缺肥、高温、干旱、雷电及使用某些农药、被污染的大气等均可引起基因突变，改变原来的种性。 （5）选留种时标准不明确。水稻自留选种时片面注意穗大粒多粒重，对其他性状，如分蘖多少、植株高矮、耐肥和耐冷性、抗病虫性强弱考虑的不全面。 | 
