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由于百香果自然授粉是靠蜜蜂、其他昆虫或外力作用进行的，故坐果率偏低。自交亲和的百香果品种，自然授粉坐果率约29.6%，人工辅助授粉可达90.6%。自交不亲和的百香果品种，柱头与花药不容易接触，需要大型昆虫传粉，自然稔实率在10%以下，而人工异花授粉坐果率约为80%。因此，自交亲和或不亲和的百香果，人工辅助授粉可以大大地提高产量。 
百香果采取人工授粉需选晴朗天气进行，不宜阴雨天开展此工作。自交亲和品种采集何种花粉都可以；自交不亲和品种，只能采集同种异株的花粉，不能采集自花、同株异花以及同株繁殖的无性苗植株花粉。 
百香果的花在夜间或清晨开始开放，早上7时处于半开状态，到上午10时则已全开，但这时花药尚未释放花粉，约到下午1时才散发出花粉，此时采集花粉。授粉必须在花完全展开至当天下午4时之前进行。在此之前或之后，柱头接受花粉的能力低。花粉在干燥条件下，从花药散出来至第二天仍保持活力，随后生活力迅速下降；百香果的花粉若被雨水冲刷20秒后就失去活力。在干热（最高温度为36.1℃）条件下给百香果授粉，几乎不能坐果。人工授粉可提高百香果坐果率，从而提高产量，还可以增加单果重、种子数、出汁率和果汁含糖量。 | 
